Педиатрическое отделение для детей раннего возраста было открыто на 3 этаже детского корпуса. В отделение госпитализировали детей от 1 месяца до 3-х лет. Первой заведующей отделением была Гарифуллина Фануза Мирхазиевна, врач-педиатр 1 категории, имеющая опыт работы с детьми раннего возраста.
В последующие годы отделением заведовали Кутдусова Анна Афанасьевна, которая усовершенствовала работу и внесла вклад в укрепление материальной базы отделения. С 1975 по 1981 гг. отделением заведовала врач-педиатр высшей категории, прекрасный специалист и человек Байбурина Асия Толгатовна, которая впоследствии работала главным педиатром Министерства здравоохранения Республики Башкортостан.
В процесс становления отделения большой вклад внесли зав. кафедрой детских болезней лечебного факультета, заслуженный деятель науки Республики Башкортостан, доктор медицинских наук, профессор Гатауллина Лира Даяновна и сотрудники кафедры. Курировал отделение кандидат медицинских наук, доцент кафедры Андржанов Фарит Казыханович, который в последующем в 1981- 1987 гг. заведовал кафедрой.
В 1981 году, после окончания клинической ординатуры по педиатрии, на должность заведующей отделением была назначена врач-педиатр высшей категории Тамамян Валентина Артемовна, работающая в этой должности по настоящее время. За долгие годы работы Тамамян В.А. проявила себя как прекрасный организатор, клиницист высочайшего уровня и человек глубокой порядочности. Высокий профессионализм В.А. Тамамян в работе отмечен грамотами ГКБ №6, Клиники БГМУ, Управления здравоохранения городского округа город Уфа РБ, Администрации городского округа город Уфа РБ и званием «Отличник здравоохранения СССР» (1986 г.).
В 2002 г. отделение преобразовано в педиатрическое отделение 2, является клинической базой кафедры детских болезней БГМУ. Зав. кафедрой детских болезней - доктор медицинских наук, профессор, заслуженный врач РБ Эткина Эсфирь Исааковна. Куратор отделения - доцент, кандидат медицинских наук Сакаева Гульнара Дабировна. Благодаря большой работе, проводимой профессором Эткиной Э.И. совместно с зав. отделением и сотрудниками кафедры в последние годы активно внедряются высокотехнологичные методы диагностики и лечения детей при бронхолегочных заболеваниях, аллергических заболеваниях, иммунодефицитных состояниях, заболеваниях сердечно-сосудистой системы; решаются вопросы реабилитации детей раннего возраста с различными заболеваниями.
В целом, отделение работает стабильно, выполняя плановое задание, и имеет хорошие показатели.