В отделении онкологии выполняются малоинвазивные, органосохраняющие операции (удаление части почки при ее заболеваниях, операции без разрезов из 2-3 проколов, операции на мочеточниках, мочевом пузыре предстательной железе через мочеиспускательный канал, без разреза передней брюшной стенки). Профессора и доценты кафедры выполняют сложнейшие реконструктивно-пластические операции (создание нового мочевого пузыря, нового мочеточника и др.), удаление предстательной железы при раке простаты.
В отделении онкологии Клиники БГМУ выполняется брахитерапия – метод лечения рака предстательной железы без большой операции, путем установки в нее специальных лечебных зерен.
Оперативное лечение и консультативную помощь оказывают профессора и доценты кафедры урологии ФГБОУ ВО «Башкирский государственный медицинский университет» Минздравсоцразвития РФ.